GauPro (version 0.2.4)

GauPro_Gauss_LOO: Corr Gauss GP using inherited optim

Description

Corr Gauss GP using inherited optim

Corr Gauss GP using inherited optim

Value

Object of R6Class with methods for fitting GP model.

Format

R6Class object.

Super classes

GauPro::GauPro -> GauPro::GauPro_Gauss -> GauPro_Gauss_LOO

Methods

Public methods

• GauPro_Gauss_LOO$update()

• GauPro_Gauss_LOO$pred_one_matrix()

• GauPro_Gauss_LOO$clone()

• GauPro::GauPro$cool1Dplot()

• GauPro::GauPro$deviance_searchnug()

• GauPro::GauPro$fit()

• GauPro::GauPro$grad_norm()

• GauPro::GauPro$initialize_GauPr()

• GauPro::GauPro$loglikelihood()

• GauPro::GauPro$nugget_update()

• GauPro::GauPro$optim()

• GauPro::GauPro$optimRestart()

• GauPro::GauPro$plot1D()

• GauPro::GauPro$plot2D()

• GauPro::GauPro$pred()

• GauPro::GauPro$pred_LOO()

• GauPro::GauPro$pred_mean()

• GauPro::GauPro$pred_meanC()

• GauPro::GauPro$pred_var()

• GauPro::GauPro$predict()

• GauPro::GauPro$sample()

• GauPro::GauPro$update_K_and_estimates()

• GauPro::GauPro$update_corrparams()

• GauPro::GauPro$update_data()

• GauPro::GauPro$update_nugget()

• GauPro::GauPro_Gauss$corr_func()

• GauPro::GauPro_Gauss$deviance()

• GauPro::GauPro_Gauss$deviance_fngr()

• GauPro::GauPro_Gauss$deviance_grad()

• GauPro::GauPro_Gauss$deviance_log()

• GauPro::GauPro_Gauss$deviance_log2()

• GauPro::GauPro_Gauss$deviance_log2_fngr()

• GauPro::GauPro_Gauss$deviance_log2_grad()

• GauPro::GauPro_Gauss$deviance_log_grad()

• GauPro::GauPro_Gauss$deviance_theta()

• GauPro::GauPro_Gauss$deviance_theta_log()

• GauPro::GauPro_Gauss$get_optim_functions()

• GauPro::GauPro_Gauss$grad()

• GauPro::GauPro_Gauss$grad_dist()

• GauPro::GauPro_Gauss$hessian()

• GauPro::GauPro_Gauss$initialize()

• GauPro::GauPro_Gauss$param_optim_jitter()

• GauPro::GauPro_Gauss$param_optim_lower()

• GauPro::GauPro_Gauss$param_optim_start()

• GauPro::GauPro_Gauss$param_optim_start0()

• GauPro::GauPro_Gauss$param_optim_upper()

• GauPro::GauPro_Gauss$print()

• GauPro::GauPro_Gauss$update_params()

Method update()

Usage

GauPro_Gauss_LOO$update(
  Xnew = NULL,
  Znew = NULL,
  Xall = NULL,
  Zall = NULL,
  restarts = 5,
  param_update = self$param.est,
  nug.update = self$nug.est,
  no_update = FALSE
)

Method pred_one_matrix()

Usage

GauPro_Gauss_LOO$pred_one_matrix(XX, se.fit = F, covmat = F)

Method clone()

The objects of this class are cloneable with this method.

Usage

GauPro_Gauss_LOO$clone(deep = FALSE)

Arguments

deep

Whether to make a deep clone.

Examples

# NOT RUN {
n <- 12
x <- matrix(seq(0,1,length.out = n), ncol=1)
y <- sin(2*pi*x) + rnorm(n,0,1e-1)
gp <- GauPro_Gauss_LOO$new(X=x, Z=y, parallel=FALSE)
# }