MultivariateAnalysis (version 0.5.1)

CorrelacaoMantel: Estimacao da correlacao e significancia pelo metodo Mantel.

Description

Esta funcao faz a correlacao entre matrizes e estima sua significancia pelo teste Mantel.

Usage

CorrelacaoMantel(Mat1,Mat2,
                        nperm=999,
                        alternativa="bilateral",
                        Plot=TRUE,
                        xlab="Dist1",
                        ylab="Dist2",
                        bty="l")

Value

A funcao retorna resultados do teste Tocher.

Arguments

Mat1

Objeto contendo a matriz de dissimilaridade. A matriz deve ser quadrada e simetrica. Ou um objeto do tipo `dist`.

Mat2

Objeto contendo a matriz de dissimilaridade. A matriz deve ser quadrada e simetrica. Ou um objeto do tipo `dist`.

nperm

Numero de permutacoes para identificar a signficancia pelo metodo de Mantel

alternativa

Character indicando a hipotese alternativa considerada. Pode ser:

• "bilateral": Testa se a correlacao e diferente de zero.

• "maior" : Testa se a correlacao e maior de zero.

• "menor : Testa se a correlacao e menor de zero.

Plot

Valor logico (TRUE ou FALSE) indicando se aparecera o grafico de correlacao entre as matriz cofenetica e de dissimilaridade

xlab

nome do eixo x do grafico

ylab

nome do eixo y do grafico

bty

deve receber um character indicando o tipo de borda desejado no grafico.

• "o": Todas as bordas

• "n": Sem bordas

• "7": Acima e a direita

• "L": Abaixo + esquerda (Default)

• "C": Acima + Direita + Abaixo

• "U": Direita + Abaixo + Direita

References

PlayList "Curso de Analise Multivariada": https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK72M3lFl7kBaHiVh5W53mlR

Cruz, C.D.; Ferreira, F.M.; Pessoni, L.A. (2011) Biometria aplicada ao estudo da diversidade genetica. Visconde do Rio Branco: Suprema.

Rao, R.C. (1952) Advanced statistical methods in biometric research. New York: John Wiley & Sons.

Sharma, J.R. (2006) Statistical and biometrical techniques in plant breeding. Delhi: New Age International. Silva, A.R. & Dias, C.T.S. (2013) A cophenetic correlation coefficient for Tocher's method. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, 48:589-596.

Vasconcelos, E.S.; Cruz, C.D.; Bhering, L.L.; Resende Junior, M.F.R. (2007) Alternative methodology for the cluster analysis. Pesquisa Agropecuaria Brasileira, 42:1421-1428.

Examples

# \donttest{
data(Dados.MED)
#Distancia euclidiana.
Mat1=Distancia(Dados.MED,1)
#Quadrado da distancia euclidiana padronizada media (Dados Quantitativos)".
Mat2=Distancia(Dados.MED,6)
CorrelacaoMantel(Mat1,Mat2)
# }