MultivariateAnalysis (version 0.5.1)

HeatPlot: Grafico de calor para a interpretacao do Dendrograma

Description

Esta funcao apresenta um mapa de calor junto com o Dendrograma.

Usage

HeatPlot(Dendo,Col=NULL,layout=1,cut=1000)

Arguments

Dendo

Objeto criado pela funcao `Dendrograma`.

Col

Paleta de cores. Veja os exemplos.

layout

Deve ser um numero variando de 1 a 3. Para cada numero teremos um layout diferente.

cut

Valor do corte no dendrograma para o estabelecimento de cluster.

References

PlayList "Curso de Analise Multivariada": https://www.youtube.com/playlist?list=PLvth1ZcREyK72M3lFl7kBaHiVh5W53mlR

CRUZ, C.D. and CARNEIRO, P.C.S. Modelos biometricos aplicados ao melhoramento genetico. 3nd Edition. Vicosa, UFV, v.2, 2014. 668p. (ISBN: 8572691510)

FERREIRA, D.F. Estatistica Multivariada. (2018) 3ed. UFLA. 624p. (ISBN 13:978 8581270630)

HAIR, J.F. Multivariate Data Analysis. (2016) 6ed. Pearson Prentice HalL. (ISBN 13:978 0138132637)

See Also

Distancia ,Dendrograma

Examples

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#PlotHeat
#Distancia euclidiana
data("Dados.MED")
dist=Distancia(Dados.MED,Metodo = 3)
dist
Dendo=Dendrograma(dist)
HeatPlot(Dendo)
#Distancia Mahalanobis
data("Dados.DBC")
m=MANOVA(Dados.DBC,Modelo = 2)
m
dist=Distancia(m$Med,Cov=m$CovarianciaResidual,Metodo = 7)
dist
Dendo=Dendrograma(dist)
HeatPlot(Dendo)
col0 = colorRampPalette(c('white', 'cyan', '#007FFF', 'blue','#00007F'))
col1 = colorRampPalette(c('#7F0000', 'red', '#FF7F00', 'yellow', 'white',
                          'cyan', '#007FFF', 'blue','#00007F'))
col2 = colorRampPalette(c('#67001F', '#B2182B', '#D6604D', '#F4A582',
                          '#FDDBC7', '#FFFFFF', '#D1E5F0', '#92C5DE',
                          '#4393C3', '#2166AC', '#053061'))
col3 = colorRampPalette(c('red', 'white', 'blue'))
col4 = colorRampPalette(c('#7F0000', 'red', '#FF7F00', 'yellow', '#7FFF7F',
                          'cyan', '#007FFF', 'blue', '#00007F'))
HeatPlot(Dendo,Col=col1)
HeatPlot(Dendo,Col=col3)
HeatPlot(Dendo,Col=col4)


#Dados binarios
data("Dados.BIN")
Dist=Distancia(Dados.BIN,Metodo=12)
Dist
Dend=Dendrograma(Dist)
HeatPlot(Dend)
HeatPlot(Dend,Col=col3)

#Dados cat
data("Dados.CAT")
row.names(Dados.CAT)=paste0("T",1:nrow(Dados.CAT))
Dist=Distancia(Dados.CAT,Metodo=10)
Dist
Dend=Dendrograma(Dist)
HeatPlot(Dend)