Learn R Programming

ExpImage (version 0.10.1)

Analysis of Images in Experiments

Description

Tools created for image analysis in researches. There are functions associated with image editing, segmentation, and obtaining biometric measurements (Este pacote foi idealizado para para a analise de imagens em pesquisas. Ha funcoes associadas a edicao de imagens, segmentacao, e obtencao de medidas biometricas) .

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Version

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install.packages('ExpImage')

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42

Version

0.10.1

License

GPL-3

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Repository

https://github.com/cran/ExpImage

Homepage

https://www.youtube.com/channel/UCDGyvLCJnv9RtTY1YMBMVNQ

Maintainer

Alcinei Mistico Azevedo

Last Published

May 10th, 2024

Functions in ExpImage (0.10.1)

Funcao para eliminar as bordas dos objetos.

Estimation of vegetation indices (Estimacao de indices de vegetacao).

Image information (Informacoes sobre as imagens).

Creates a mask over the background or foreground in a raster image (Cria uma mascara sobre o background ou foreground em uma imagem no formato raster)

Function to obtain measurements associated with objects in binary images (Funcao para obter medidas associadas aos objetos em imagens binarias).

histogram_image

Create a histogram from image bands (Criar um histrograma a partir das bandas das imagens)

Function to get a grayscale image from a color image (Funcao para a obtencao de uma imagem em escala de cinza a partir de uma imagem colorida)

pick_segmentation

Segmenting objects manually (Segmentação de objetos manualmente)

Selecionar os valores de RGB em pixels (Selecting RGB values in pixels).

Count objects (Contar objetos).

pick_resolution

Get the dpi resolution on an image (Obter a resolução em dpi em uma imagem).

Esta funcao plota imagens. (This function plot the images.)

Function to plot multiple indices (funcao para plotar varios indices)

normalize_image

Create a histogram from image bands (Criar um histrograma a partir das bandas das imagens)

Segmentation with the shape of a circle by clicking on the image (Segmentacao com o formato de um circulo clicando em na imagem)

Function to compare image sizes (Funcao para comparar os tamanhos das imagens).

Join images(Juntar imagens)

Convert a image in raster format to ExpImage format (Converte uma imagem no formato raster para o formato ExpImage)

Image segmentation function (Funcao para a segmentacao de imagens).

Esta funcao rotaciona a imagem. (This function rotates the image .)

Segmentacao a partir de modelo logit (Segmentation from the logit model)

Function to change image size (Funcao para mudar o tamanho da imagem)

Function to import an image (Funcao para importa uma imagem).

segmentation_logit

Funcao para a segmentacao de imagens.

segmentation_RF

Image segmentation by Random Forest (Segmentacao de imagens por Random Forest).

linearize_image

Image linearization (Linearizacao da imagem).

Creates a mask over the background or foreground (Cria uma mascara sobre o background ou foreground)

Measure objects in the image on click (Medir objetos na imagem ao clicar).

Obter uma paleta de cores com cliques (Get a color palette with clicks ).

Funcao para sobrepor informacoes sobre os objetos da imagem

shape_file.create

Funcao para criar as coordenadas dos objetos/parcelas na imagem

This function splits the image into several others (Esta funcao divide a imagem em varias outras de acordo com os objetos que contem)

Pixel classification by Random Forest methodology (Classificacao de pixels pela metodologia Random Forest)

shape_file.split

Divide a imagem em objetos/parcelas de acordo com o shapefile

segmentation_logitGUI

Funcao para a segmentacao de imagens.

segmentation_steps

Image segmentation function (Funcao para a segmentacao de imagens).

This function makes the thinning images(Esta funcao faz o thinning em imagens).

Summarize the colors present in the segmented area of an image (Sumarizar as cores presentes na area segmentada de uma imagem).

skeletonize_image

Function for skeletonization in images (Esta funcao faz a skeletonizacao em imagens).

shape_file.plot

Plotar os objetos/parcelas do shapefile na imagem

shape_file.BorderExtract

Excluir as bordas do objetos/parcelas do shapefile

Definir o diretório do script working directory (Set the script Directory as working directory).

Image information in tif format (Informacoes das imagens no formato tif).

Function to save an image (Funcao para salvar uma imagem).

Transform the square image (Transforme a imagem quadrada).

ExpImage-package

ExpImage: Experimental Image Analysis Tools

Creates a color palette from an image (Criar uma paleta de cores a partir de uma imagem).

calibration_palette

Function to create a color palette for image color calibration (Funcao para criar uma paleta de cores para calibracao das cores de imagens).

clustering_Kmeans

Image segmentation by clustering using the Kmeans method (Segmentacao de imagens pela clusterização pelo metodo Kmeans).

Filter values in an array or image (Filtrar valores em uma matriz ou imagem).

Normatiza a matriz para que os valores variem entre valores pre-estabelecidos.

This function changes the brightness, contrast and makes the gamma adjustment in the image (Esta funcao permite mudar o brilho, contraste e fazer um ajuste gamma na imagem).

Contorno da imagem segmentada (Outline of the segmented image.)

Create a png image with a transparent background (Criar uma imagem png com o fundo transparente)

Images used as an example (Banco de imagens utilizadas como exemplo).

Funcao para acrescentar bordas nos objetos.

This function changes the brightness, contrast and makes the gamma adjustment in the image (Esta funcao permite mudar o brilho, contraste e fazer um ajuste gamma na imagem).

Esta funcao corta a imagem retirando as laterais nao desejadas. (This function removes unwanted sides from the images.)

Function to compare image sizes (Funcao para comparar os tamanhos das imagens).

Convert colors (Converter cores).

Transform matrix into image (Transformar matriz em imagem).

Exlude objects in an image by encircling them or using a mask (Excluir objetos em uma imagem circundado-os ou usando uma mascara).

Function to exclude pixels from the background or foreground in an image (Funcao para excluir em uma imagem os pixels correspondente ao background ou foreground)

Obter o diretorio onde esta o script. (Get the script directory.)