GenRegRes

ThetaRegRes

class:GenRegRes

class:ThetaRegRes

GenRegRes-class

ThetaRegRes-class

getF1Scores

getF1Scores,GenRegRes-method

getF1Scores,ThetaRegRes-method

f1Count

f1Count,GenRegRes-method

f1Count,ThetaRegRes-method

getParams

getParams,GenRegRes-method

getParams,ThetaRegRes-method

getRegularisedParams

getRegularisedParams,GenRegRes-method

getRegularizedParams

getRegularizedParams,GenRegRes-method

getSeed

getSeed,GenRegRes-method

getWarnings

getWarnings,GenRegRes-method

levelPlot

levelPlot,GenRegRes-method

plot,GenRegRes,missing-method

plot,ThetaRegRes,missing-method

show,GenRegRes-method

show,ThetaRegRes-method

combineThetaRegRes

favourPrimary

classes

This package implements pattern recognition techniques on
    quantitiative mass spectrometry data to infer protein
    sub-cellular localisation.

Laurent Gatto

pRoloc

A unifying bioinformatics framework for spatial proteomics

GenRegRes-class function

Object of this class are created with the respective regularisation
  function: <code><a href="/link/knnOptimisation?package=pRoloc&version=1.12.3" rd-options="" data-mini-rdoc="pRoloc::knnOptimisation">knnOptimisation</a></code>,
  <code><a href="/link/svmOptimisation?package=pRoloc&version=1.12.3" rd-options="" data-mini-rdoc="pRoloc::svmOptimisation">svmOptimisation</a></code>, <code><a href="/link/plsdaOptimisation?package=pRoloc&version=1.12.3" rd-options="" data-mini-rdoc="pRoloc::plsdaOptimisation">plsdaOptimisation</a></code>,
  <code><a href="/link/knntlOptimisation?package=pRoloc&version=1.12.3" rd-options="" data-mini-rdoc="pRoloc::knntlOptimisation">knntlOptimisation</a></code>, ...

Objects from the Class

Class <code>"GenRegRes"</code> and <code>"ThetaRegRes"</code>

GenRegRes-class: Class `"GenRegRes"` and `"ThetaRegRes"`

Description

Arguments

Objects from the Class

Examples